新生儿低血糖症是指血糖低于正常新生儿的最低血糖值。多数新生儿生后数小时内血糖降低，足月儿通过动员和利用其他原料代替葡萄糖，部分新生儿可出现持续或进行性血糖降低。低血糖使脑组织失去基本能量来源，无法进行代谢和生理活动，严重者导致神经系统后遗症。

胎儿肝糖原贮备主要发生在出生前4~8周，胎儿棕色脂肪的分化从胎龄26~30周开始，延续至生后2~3周。早产儿和SGA儿能量贮存少，生后代谢所需能量又相对高，易发生低血糖症。SGA儿脑与肝重量比由正常的3∶1增至7∶1，脑葡萄糖利用率是肝的2倍。IUGR、胎盘功能不全或围产期窒息者由于糖异生及糖原分解前体不足易发生低血糖症。

严重疾病如新生儿窒息、RDS、硬肿症和败血症等易发生低血糖。这些情况常伴有代谢率增加、缺氧、低体温和摄入减少。寒冷或低体温的新生儿低血糖症发生率高，这与低体温时产热能力不能满足体温调节需求有关。

新生儿感染时炎症介质抑制糖异生及糖原分解的关键酶，使葡萄糖来源减少，而葡萄糖消耗率较正常增加3倍左右；感染时患儿的摄入、消化吸收功能均减弱，易导致低血糖症。缺氧缺血使糖酵解时间延长，糖原贮存减少，激素相互作用及酶反应性降低，从而抑制脑能量摄取。

暂时性高胰岛素血症常见于糖尿病母亲的婴儿，这些婴儿有丰富的糖原和脂肪贮备，母孕期血糖高，胎儿血糖随之增高，胰岛细胞代偿性增生产生胰岛素，生后来自母亲的葡萄糖中断，可致低血糖。严重溶血病的胎儿由于红细胞破坏，红细胞内谷胱甘肽游离于血浆中，对抗胰岛素作用，也可使胎儿胰岛细胞代偿性增生，发生高胰岛素血症。

新生儿溶血病患儿用枸橼酸葡萄糖作保养液的血液换血，因保养液中葡萄糖浓度较高，刺激胰岛素分泌，换血后短时间内血中胰岛素水平仍较高，可出现低血糖。持续性高胰岛素血症见于胰岛细胞腺瘤、胰岛细胞增殖症和贝–维综合征等。

新生儿半乳糖血症时因血中半乳糖增加，葡萄糖相应减少。糖原贮积症患儿糖原分解减少，血中葡萄糖水平低。亮氨酸过敏的新生儿，母乳中的亮氨酸刺激新生儿产生胰岛素。其他如垂体、甲状腺或肾上腺等先天性功能不全也可影响血糖水平。