肠道菌群建立过程中，新生儿肠道的有氧环境导致最初定植的是兼性厌氧菌，它们逐渐消耗肠道内的氧气，为厌氧菌的定植做好准备，比如双歧杆菌。我们胃肠道中复杂菌群的最初定植和发育可以受到一些常见的医疗干预措施的影响，比如剖宫产、产妇产时预防性使用抗生素、产后住院和产后婴儿抗生素治疗等等。双歧杆菌属和拟杆菌科细菌（比如脆弱拟杆菌）的减少是每一种干预措施后最常见的菌群组成紊乱，特别是剖宫产后。另一方面，梭菌属和肠杆菌科细菌（比如克雷伯氏菌、大肠杆菌）在剖宫产、孕期使用抗生素、产后住院和接受抗生素治疗的婴儿中可能变得更为丰富；通常，肠球菌属和葡萄球菌属细菌也变得更加丰富。剖宫产以及孕妇或婴儿使用抗生素对肠道菌群的影响不同：孕妇产时预防性使用青霉素或头孢菌素，或者新生儿静脉注射青霉素加庆大霉素，与婴儿肠道中肠球菌和金黄色葡萄球菌数量更高有关；新生儿静脉注射氨苄青霉素加庆大霉素治疗后肠道中出现了克雷伯氏菌；紧急剖宫产的婴儿肠道中韦荣球菌属细菌增多；而新生儿口服头孢氨苄治疗两个月后，韦荣球菌消失。围产期医疗干预引起的菌群失调也发生在早期母乳喂养的婴儿中并且会因为早产而加剧。

剖宫产的孕妇在产后往往也会接受更多的医疗干预，更少的母婴接触以及不理想的母乳喂养行为。这不仅对孕妇本身有影响，也会破坏婴儿时期肠道菌群的正常发育。今天，我们重点